主题：【原创】请教各位高人一个数学问题 -- 天行不息

如果你确定它们是一对一的化合，那最好还是分别测定二者的分子量。照你说的看，似乎分别测定A和B并不存在问题。

蛋白质和其它物质结合以后，电泳性质一般要改变。这个改变主要受AB在电泳系统里的结构和所带电荷影响，一般不能从A与B独自的性质直接推出来，而是取决于二者化合的方式，也取决于电泳方法。也就是说，F1，F2和F3之间，不存在数学关系，只存在物理和化学之间的联系，不能直接推。

不过在一些情况下，电泳也能帮助大致估测分子量。在SDS电泳里，通常的做法是，如果B不带电，或者在SDS电泳里B的电荷影响很小，而且比蛋白部分小很多，就把B按蛋白质的泳动率来算。比如蛋白上的糖基化就可以这么算——虽然不准，但是多数情况下我们也不需要它那么准。但是如果B是核酸就完全不行，无论是按核酸读出来的分子量还是按蛋白读出来的分子量都不是真实的，只能作为一个表观值作为参考，不能当真。

如果你一定要直接测AB的分子量，还有其它的方法可用，比如分析超离，排阻色谱，质谱，光散射等等，也各有优缺点。具体采用什么办法还是得看这个反应产物究竟是什么东西，此外还有你需要多精确的数字，如果不需要特别精确，那跑胶也成——就按A和B里跑的快或者个子大的那个算就行了。

总之我觉得这主要是个生化问题，不是数学问题。