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主题:【文摘】复旦26岁研究生破“基因天书”密码 震惊世界 -- Melon

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家园 补充一点

猫总结得挺完整的。

点突变相对插入突变的优点是,点突变引志的基因改变较温和,所以一个动物或植物可以负载好几个点突变。缺点是:克隆基因费力,需要象猫说的找marker,做步移,一点点弄。而且找到突变以后要确定它在哪个位点之前,要先将突变与野生型杂交数次,以清除遗传背景,不然搞不清楚究竟哪个点突变对性状负责。所以点突变是筛选的工作量小,后期克隆的工作量大。插入突变往往使基因整个失活,所以生物体不能负载太多。以植物为例,用EMS处理得到点突变的库,理论上来说筛五千株可以饱各整个基因组,用T-DNA插入突变的就要筛两万。但插入片段的序列是已知的,所以可以用一些省力的方法克隆,比如反向PCR或热不稳定PCR。前期筛选工作多,但克隆的工作少。当然,如果运气十分不好,也只好用步移来克隆了。

筛选突变在其它模型生物如线虫,酵母,拟南芥,果蝇中都是常用的方法,独小鼠例外。因为小鼠的后代相对上面几种成千上万的太少,负担不起。转座子可以使整个株系的小鼠都有随机插入的片段,不必限定一个小鼠生殖细胞的全部后代。再者,在哺乳动物中能转座的transposon,可能以前还没有过报道。我没看过这方面的文献,不敢说。

再答楼下的一些论断,基本上不太着边。基因工程并不只是一个工程,它是千千万万个小项目。找到高产抗病水稻是基因工程,找到先天性心脏病基因并设法治疗也是基因工程,得到稀少的只在某些动物中表达却对人类有用的蛋白质也是基因工程。有的项目还还初级,有的却已经很成熟了,比如干扰素的生产。当然再成熟,也还是有提高的余地的。象青霉素能够便宜到象盐一样,也是基因工程的功劳。最早时靠野生菌株,四十年代的成本是三千美元一克。

没有化学基因工程这种说法。质谱是用来分离新的分子的,和寻找基因没有关系。在寻找新的蛋白的时候,可以用质谱的手段。所以在proteome中质谱用得很广泛。因为一个基因可能不止转录出一种蛋白,只知道了基因序列,不一定就能知道所有可能的蛋白种类。因此除了genome以外,有人还提出了proteome这个概念。

基因变异没有什么“选择”和“单一”,人工制造突变总是随机的。knockout和knockin我们一般不把它算成mutagenize的手段。基因芯片其实只用于microarray,笼统地讲只是测一下哪些基因在哪些情况下表达水平高低的问题,是一种很简单的东西,在实验室范围内早已得到普遍应用,跟计算机的芯片完全没有关系,分析它的软件也很直接。离临床应用还很远,因为海量的基因调控信息对临床来说意义不大。

欧洲和美国现在争议大的转基因农作物,焦点主要在于表达杀虫蛋白的农作物。因为人们对能自己杀虫的农作物总是心怀顾忌,要等到有真切可靠的临床试验,才能证明这种东西有无害处。最简单的基因工作应用,在大肠杆菌中表达免疫球蛋白和干扰素,用发酵罐生产纯化这些本来只在人的细胞中表达的蛋白。人们都说这些药贵,殊不知如果没有基因工程,这些药根本就不可能用于临床,总不能养个人天天抽血吧?

基因工程说难不难,说易也不易。不读一点入门知识是没法讨论的。用政府报告或玄学的文体讨论,更是驴唇不对马嘴。不过只要有心了解,真有兴趣的同仁看了我写的东西觉得有点意思,就值得灌水了。

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