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主题:【整理】说说最近有关biocomputing的事情 -- 喜欢喝冰茶

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家园 【整理】说说最近有关biocomputing的事情

主要是两件事, 两三个星期前S上有篇research article文章,里面提到了一个在Computational Biology上常用的计算技术的巨大进步。其实简单来说,也不是什么算法上的,而是一个砸钱的事情,但是是从底层改进。喜欢跟一个或者几个蛋白或者family较劲的朋友们,可以去看看,有些事情以前是望洋兴叹的事儿,现在基本上就是现实了。但是想跟他们合作得先掂量掂量自己玩儿东西的分量,没到NCS级的就不用了,套用国内一句话叫人家“不差钱”。

另外一件事儿是给那些喜欢HTS的同学们玩儿的,去google一下ion torrent,如果真如他们所说的那样,PGM能够两个小时搞定一个individual的genome的话,几年之内SNP和Exome的成本压到100美刀根本就不是问题,因为现在的实验成本也就是200左右,前提是真如它所说,所以搞药的,做遗传的,折腾SNP,CNV或者rare variants的,还是这个seq,那个seq的,methylated的同学们,你们的曙光在前,不过前提是后期处理得能跟上。所以立志于挣钱找工作的bioinfo童鞋们,如果会NGS,你就等工作找你吧,如果不会,赶快学去。其它的那些方面没这个能管饭。

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